Для автоматизации учета магазинам лучше применять специальные учетные программы и оборудование http://m-count.ru/ekspress-analiz-sostoyaniya-buhgalterskogo-ucheta
  В таком случае бухучет ведется отдельно по каждому виду ТМЦ, и система списывает их себестоимость автоматически по закупочным ценам в количественно-суммовом отражении https://m-count.ru/uslugi
 
Оптово-розничные компании, ИП, расчет налогов по системам налогообложения: ОСНО, УСН, ЕНВД, совмещение режимов, Подготовка и сдача деклараций в Росалкогольрегулирование, Росприроднадзор Импортно/экспортные операции 
- деятельность по ведению (восстановлению) бухгалтерского учета, в том числе по составлению бухгалтерской (финансовой) отчетности, бухгалтерскому консультированию 
Посредник не является собственником приобретаемых или покупаемых товаров и услуг в интересах принципала https://m-count.ru/vosstanovlenie-ucheta
  То есть поступившие товары и услуги не могут быть признаны расходами, а переданные — доходами компании https://m-count.ru/buhgalterskie-uslugi-dlya-nachinayushchih-kompanij
  В доходах будет отражена только сумма выставленного по договору агентского вознаграждения https://m-count.ru/buhgalterskie-uslugi-dlya-nachinayushchih-kompanij
  С нее же необходимо будет исчислить и уплатить в бюджет НДС, если вы работаете на ОСНО https://m-count.ru/
  Поступление материальных ценностей в учете отражается на забалансовых счетах: 

Дебет 50 (51) Кредит 76 субсчет Расчеты с посредником за реализованные товары (работы, услуги)– получены от посредника денежные средства за реализованные товары (работы, услуги) (за вычетом суммы вознаграждения и суммы возмещаемых по договору расходов